市中研附院消化二科（内镜中心）是医院重点发展学科，由医院引进高端技术人才队伍组建而成，是国家消化道早癌防治中心联盟单位，全国脂肪肝数据管理中心建设项目实施单位，大肠癌筛查项目定点单位科室。以消化内镜精查、内镜微创诊疗和肝、胆、胰、食管、胃、肠疾病的中西医防治为特色和见长。主要开展：食管胃肠道息肉，消化道早癌/粘膜下肿瘤，消化道出血，急慢性胰腺炎，胆石症（胆囊结石、胆总管结石等），胆囊息肉，肝功能异常，肝硬化及并发症，反流性食管炎，消化性溃疡，炎症性肠病等消化道炎症及肿瘤性疾病的中西医结合诊治。
消化二科（内镜中心）围绕国际、国内消化内镜诊疗技术热点，致力于推广、普及大众对消化系统疾病的认识及防治，特别是消化道早癌的诊疗以及胆石症的防治。拥有奥林巴斯290系列胃肠镜、超声内镜、放大及色素内镜、超细内镜、双腔治疗内镜、十二指肠镜、胶囊内镜、ERBE Vio3电外科工作站、佳能X线机Ultimax-i和清洗消毒等设备。科室成熟开展了多项前沿“4E”超级微创技术：如消化道早癌/粘膜下肿瘤切除术（ESD/ESE/STER/EFTR）,胆胰疾病ERCP(胆胰管狭窄/扩张/结石/肿瘤等)，超声内镜（EUS）诊断及治疗技术（如EUS-FNA，胰腺假性囊肿穿刺置管引流术），经自然腔道内镜手术NOTES（保胆取石和息肉切除术），贲门失迟缓症POEM，食管胃静脉曲张出血精准断流止血术（ESVD），消化道息肉切除术，消化道良恶性狭窄扩张/支架置入术，消化道异物取出/置管术，肠镜下阑尾炎治疗（ERAT）和内痔治疗等，王毓麟主任开展的胃镜下保胆取石和保胆息肉切除术更是填补了天津市的技术空白。
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